近期,中国科学院深圳先进技术研究院研究团队开发了空间噬菌体辅助连续定向进化系统(Spatial Phage-Assisted Continuous Evolution, SPACE),并利用该系统平行进化了T7 RNA聚合酶识别随机启动子序列的能力。该研究在《Molecular Systems Biology》发表,题为:Exploiting spatial dimensions to enable parallelized continuous directed evolution。
研究人员构建了细菌-噬菌体共迁移实验体系,采用理论模型结合实验进化的方式,解析细菌迁移过程中噬菌体感染宿主的进化动力学,并通过对噬菌体复制包装及诱导突变等关键功能模块的设计和改造,构建了SPACE系统。SPACE系统克服了哈佛大学开发的噬菌体辅助连续进化(Phage-AssistedContinuous Evolution, PACE)系统中噬菌体连续培养装置的局限,从而大幅简化了系统。
SPACE系统简便、高效、效果可视化,具有大规模优化改造生物元件的平台性能力。该项工作是一个从基础理论出发,通过理性设计和构建生命体系,最终延伸到工程应用的定量合成生物学研究的例子。未来研究团队将利用SPACE这个平台性技术,进化一系列应用于医药、农业、化工等领域的重要生物大分子,力求解决科研和产业中的实际问题。
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